Les écosystèmes forestiers couvrent environ 52% du territoire national (Figure 49). Elles comprennent 11 types de formations forestières (forêts marécageuses, forêts denses ombrophiles, forêt ombrophile de transition, forêt afro-montagnarde (avec trois variantes), forêt sèche zambézienne (Muhulu), forêt claire zambézienne (Miombo), forêt claire soudanienne, forêt sclérophylle littorale, mangroves. La bambousaie à Oxytenanthera abysinica et les mangroves à palétuviers sont deux écosystèmes uniques et peu représentatifs du pays. Tous ces types de formations sont incluses dans les aires protégées à l’exception de la bambousaie à Oxytenanthera abysinica.  

Dans l’ensemble, la diversité spécifique y est élevée avec la présence de plusieurs espèces endémiques et/ou menacées de disparition. A titre indicatif il y a parmi les végétaux : Encephalartos septentrionalis, Diospyros grex, Eremospatha haullevilleana, Pericopsis elata, Sclerosperma mannii, Gnetum africanum, Millettia laurentii et Juniperus procera. Chez les animaux, on peut trouver dans ces forêts le bonobo (Pan paniscus), le paon congolais (Afropavo congensis), le gorille de montagne et de plaines (Gorilla 
gorilla), l’okapi (Okapia johnstoni) et, dans les eaux saumâtres des mangroves, le lamantin aquatique (Trichechus senegalensis).